商铺办房产证需要缴纳的税费主要包括契税、印花税、房屋登记费以及其他可能的附加税费。

一、契税

契税是商铺办理房产证时需要缴纳的主要税费之一。契税的征收标准通常由地方政府根据当地情况制定，一般按照商铺的购买价格的一定比例征收。契税的税率可能因地区、政策等因素有所差异，因此具体的税率需要咨询当地税务部门或房地产交易机构。

二、印花税

印花税是在产权转移等行为发生时征收的税费。在商铺办理房产证的过程中，涉及到产权的转移，因此需要缴纳印花税。印花税的税率通常是根据产权转移的金额来确定的，具体的税率和计算方式也需要根据当地的规定来确定。

三、房屋登记费

房屋登记费是办理房产证时的固定费用，用于支付房屋登记机构的登记服务费用。房屋登记费的金额通常是根据商铺的面积或购买价格的一定比例来确定的，具体金额需要参照当地的相关规定。

四、其他附加税费

除了上述主要的契税、印花税和房屋登记费外，商铺办理房产证还可能涉及到其他附加税费。这些附加税费可能因地方政策的不同而有所差异，例如土地增值税、个人所得税等。在办理房产证前，建议咨询当地税务部门或专业律师，了解清楚可能存在的附加税费情况。

综上所述：

商铺办房产证需要缴纳的税费包括契税、印花税、房屋登记费以及其他可能的附加税费。具体金额会根据商铺的购买价格、面积、所在地区以及当地的税务政策而有所不同。在办理房产证前，建议咨询当地税务部门或专业律师，了解清楚具体的税费计算方式和金额，以便做好预算和准备。

法律依据：

《中华人民共和国契税暂行条例》

第三条规定：

契税税率为3%至5%。契税的适用税率，由省、自治区、直辖市人民政府在前款规定的幅度内按照本地区的实际情况确定，并报财政部和国家税务总局备案。

《中华人民共和国印花税暂行条例》

第二条规定：

下列凭证为应纳税凭证：

（一）购销、加工承揽、建设工程承包、财产租赁、货物运输、仓储保管、借款、财产保险、技术合同或者具有合同性质的凭证；

（二）产权转移书据；

（三）营业账簿；

（四）权利、许可证照；

（五）经财政部确定征税的其他凭证。

《房屋登记办法》

第十二条规定：

申请房屋登记，应当由有关当事人双方共同申请，但本办法另有规定的除外。

有下列情形之一，申请房屋登记的，可以由当事人单方申请：

（一）因合法建造房屋取得房屋权利；

（二）因人民法院、仲裁委员会的生效法律文书取得房屋权利；

（三）因继承、受遗赠取得房屋权利；

（四）有本办法所列变更登记情形之一；

（五）房屋所有权依法收回；

（六）法律、法规规定的其他情形。