法律分析：1、时间期限不同：宅基地使用者没有期限限制，土地使用证有30年50年70年的期限限制，划拨土地使用证也没有期限限制。2、用途不同：厂房、村办企业的建的的房屋的地下的土地不能叫宅基地使用证，可以叫集体土地建设用地使用证；而宅基地使用证泛指集体组织成员的人（也就是本村农户的人）建的住宅房屋地下的土地。3、耕地在国土资源局的规划档案里面是有记录的。耕种土地不可以随便变更用途，宅基地倒是可以转成耕地。

法律依据：《中华人民共和国土地管理法》 第十九条 县级土地利用总体规划应当划分土地利用区，明确土地用途。乡(镇)土地利用总体规划应当划分土地利用区,根据土地使用条件,确定每一块土地的用途，并予以公告。也就是说，一块土地到底是属于宅基地还是耕地，由国家来定。

宅基地许可证

是农村集体用地，土地所有者（多属于村或者镇）允许您使用该土地的证明。

不同于国有土地证

现在很多地方，如我们所在城市广州，已经基本上实行宅基地管理一户一宅，合乎规定的全部都领取了集体土地房产证，基本上已经不再持有宅基地证作为证明